Necesitas tener rooteado tu terminal (muchas formas de hacerlo, usa el buscador) y después tienes dos opciones para las apps:

• Usar root uninstaller o similar.
• usar un explorador de archivos con función root (la mayoría, si no es que todos) y borrar manualmente las apps (se alojan en /system/app regularmente).

Para cambiar la boot animation (video de inicio) debes cambiar el archivo /system/media/bootanimation.zip (podría cambiar la ruta en tu terminal, pero el archivo se llama igual).
Puedes conseguir otra boot animation por internet, o con este tutorial.