No te ofendas, pero te hacen falta conocimientos muy básicos de Java para poder portar esa función:

• En java no puedes usar índices que no sean numéricos en los arrays, así que hacer objeto.variable directamente no va ser posible.
• Las funciones se declaran muy parecido, pero siempre debes indicar el tipo de variable para los argumentos, así como de la función.

Una solución súper sencilla es hacer esto:

• Para cada objeto crear un array, almacenando los valores de "x" en la primera entrada y los de "y" en la segunda. En pocas palabras, tendrás que "x" está en tuArray[0] y "y" en tuArray[1].
• Modificar la función, poniendo array1[0] en lugar de obj1.x y array1[1] en lugar de obj1.y (lo mismo para el otro objeto).

EDITO: Hay otra forma de portar esa función, y queda muy parecida a Lua.

• Necesitas crear una clase nueva, y declarar las variables que usarás. Quedaría algo como
  

  package tuPackage;
   
  public class Global {
  	int x,y;
  }

  
  Nótese que no les dí valores iniciales, sólo las declaré, y que la clase se llama Global.
• Ahora, en tu clase principal crea copias de esa clase, una para cada objeto:
  

  Global copia1 = new Global();  //Hago la copia
  //Y le doy valores iniciales...
  copia1.x = 50;
  copia1.y = 0;

  
  Es importante dar valores iniciales antes de tratar de sumarle o restarle, ya que más adelante podría dar error o hacer cosas raras xD.
• Y la función quedaría declarada casi como la de Lua, pero especificando que los argumentos son de tipo Global (la clase que creaste primero):
  

  void seguir(Global obj1,Global obj2,int velocidad){  //void, porque no regresará ningún valor
    if (obj1.y-obj2.y>0)
      obj2.y=obj2.y+velocidad;
   
    if (obj2.y-obj1.y>0)
      obj2.y=obj2.y-velocidad;
  }